Die enge Kooperation zwischen den verschiedenen Projekte ist ein wichtiges Merkmal des SFBs. Entscheidend ist zudem die enge Kooperation zu weiteren Arbeitsgruppen mit engen Bezug zu den im SFB untersuchten Forschungsgebieten.
Hierzu zählen insbesondere die durch die DFG geförderten Emmy Noether Forschungsgruppen von PD Dr. J-E. Turner und Dr. N. Tomas. Diese beschäftigen sich zum einen intensiv mit der Rolle einer weiteren Lymphozyten-Population („Innate lymphoide Cells“- ILCs) in entzündlichen Nierenerkrankungen und zum anderen mit den molekularen Mechanismen der membranösen Glomerulonephritis.